该方案主要包含总体思路、重点任务和保障措施。

（一）总体思路。紧盯长江总磷污染问题，按照“整体谋划、系统治理，突出重点、因地制宜，多元共治、落实责任”原则，系统推进总磷污染防控工作，到2025年年底，总磷污染治理取得明显成效，长江干流重庆段水质保持为Ⅱ类，出境断面总磷浓度力争控制在0.05mg/L以内，全市市控及以上考核断面总磷浓度达到考核目标；全市总磷重点工程实现年减排量约1048吨。

     （二）重点任务。一是加强工业源总磷污染防治，涉及巩固“三磷”排查整治成果、优化产业布局和结构调整、提升工业园区污染防治水平。二是加强生活源总磷污染治理，涉及提高城镇生活污水收集处理能力、加强农村生活污水治理、加强生活污水处理设施运维管理、加强城市生活污水资源化利用。三是强化面源总磷污染综合防控，涉及开展城市面源污染治理、推进畜禽粪污资源化利用、严控水产养殖业总磷污染、加强种植业面源污染防治。四是大力开展生态保护修复，涉及开展重点河湖生态修复和缓冲带建设、提升水源涵养能力、加强水土流失综合治理。五是系统推进入河排污口排查整治，涉及具体整治要求和严格排污口监督管理。
    （三）强化实施保障。包括加强组织领导、加强资金保障、加强科技支撑、鼓励公众参与共4个方面要求。