重庆碳市场碳排放配额分配以制定配额分配方案的方式落实。市生态环境局根据重点排放单位的行业特点和数据有关情况，采用等量法、行业基准线法、历史强度下降法或历史总量下降法等方法核定重点排放单位配额。配额分配以免费分配为主，适时引入有偿分配。如果一个企业有多条生产线，可根据生产线的情况分别适用于不同的分配方法。